O Instituto de Biologia está subdividido em cinco departamentos, onde cada um abriga uma área específica do curso e coordena seu ensino e sua pesquisa.
Departamento de Fisiologia e Farmacologia
Este departamento está alocado nos prédios 17 e 26 do Instituto de Biologia. Nas suas dependências encontram-se também, a Biblioteca de Ciências e Tecnologia, a sala do Centro Acadêmico e a Secretaria da Direção do Instituto de Biologia.
Departamento de Microbiologia e Parasitologia
Este departamento está alocado nos prédios 18 e 25 do Instituto de Biologia.
Departamento de Morfologia
Este departamento está alocado parte no prédio 24 do Instituto de Biologia, parte em um prédio anexo a Faculdade de Medicina.
Departamento de Ecologia, Zoologia e Genética
Este departamento está alocado no prédio 23 do Instituto de Biologia.
Departamento de Botânica
Este departamento está alocado nos prédios 21 e 22 do Instituto de Biologia. Nele encontra-se também o acervo de plantas, Herbário Pel.
Para saber os laboratórios que desenvolvem pesquisa, consulte o Manual do Calouro e para saber os professores de cada Departamento acesse o link abaixo. http://ib.ufpel.edu.br/deptos.html
CAbio UFPEL 